據英國獨立報消息，圣彼得堡地鐵爆炸案發生時，俄總統弗拉基米爾·普京正視察該市。爆炸事件發生時普京正打算與白俄羅斯總統亞歷山大·盧卡申科會面。普京在爆炸時是否已經在該市，目前尚不清楚。

俄總統新聞秘書佩斯科夫表示，地鐵爆炸案已經向普京匯報，普京正在該市郊外的斯特列利納。普京表示，我們在考慮所有可能性，包括恐襲。他表示他已責成國安部門立案調查。

另據俄羅斯衛星網報道，俄羅斯聯邦國防與安全委員會主席維克多·奧澤羅夫說，圣彼得堡地鐵爆炸事件是有預謀的，地點選擇得絕非偶然。他說，總統普京當天正在圣彼得堡參加一個媒體論壇，也有很多媒體記者在場。俄羅斯衛星網報道，媒體稱“普京座駕原本要經過圣彼得堡爆炸地鐵站”，但俄羅斯總統新聞秘書德米特里·佩斯科夫予以否認。俄羅斯聯邦國家反恐委員會發言人安德烈·普爾熱茲多姆斯基認為，專家們很快將會弄清圣彼得堡地鐵爆炸原因。

據英國BBC最新消息，發生在俄羅斯圣彼得堡當地時間3日的地鐵爆炸案已致11人死亡，45人受傷。同日，俄總理梅德韋杰夫在社交媒體上表示，地鐵爆炸是一場“恐怖襲擊”。目前，針對地鐵爆炸可能的涉恐調查已經展開，但其他可能的原因亦在調查之中。